Zu Nachlässen gehören häufig auch die Buchsammlungen der Nachlasser. Sie werden im Heine-Institut nach Herkunftsprinzip aufbewahrt und erfasst, besonders forschungsrelevant sind die Spezialbestände zum Autor und seinem engeren Umkreis mit Widmungsexemplaren, grauer Literatur, etc.

Das Heine-Institut verwahrt circa 25 Nachlaßbibliotheken mit circa 30.000 Medieneinheiten, darunter zum Beispiel die Bücher aus dem Besitz von Rose Ausländer oder Rolf Bongs. Ein besonderer Schwerpunkt liegt hier auf der rheinischen Literatur.

Verzeichnet sind die bis 1998 erworbenen Bestände dieser Sammlungen im Zettel-Katalog, seit 1999 werden sie elektronisch in d:kult erfasst.